Desa Waruk terletak jauh di pedalaman yang merupakan dataran rendah yang memiliki ketinggian tanah di bawah 500 meter di atas permukaan laut. Desa Waruk memiliki luas wilayah administrasi 26.150 Ha dengan batas-batas wilayah sebagi berikut :
- Sebelah Utara : Desa Sugihwaras Kec. Kalitengah
- Sebelah Timur : Desa Sukorejo Kec. Karangbinangun
- Sebelah Selatan : Desa Kepudi Bener Kec. Turi
- Sebelah Barat : Desa Bojoasri Kec. Kalitengah
Penggunaan lahan untuk tanah pekarangan atau permukiman sebesar 6.150 Ha dan lahan untuk persawahan atau tambak sebesar 25 ha serta 4.306 m digunakan untuk lain-lain. Pola penggunaan lahan di Desa Waruk lebih didominasi oleh kegiatan pertanian dan perikanan dengan menggunakan lahan irigasi teknis